گروه ورزش|شهرآرانیوز، کریم باقری در ماه‌های اخیر با انتقاد‌های بسیاری از سوی رسانه‌ها مواجه شده و بسیاری براین باورند او نه در پرسپولیس و نه در تیم ملی نقش آن چنانی بازی نمی‌کند و مسئولیت‌های فنی برعهده دیگر مربیان است. بعد از طرح این انتقاد‌ها حمید استیلی از قول نهاد‌های نظارتی اعلام کرده که کریم باقری باید از میان تیم ملی و پرسپولیس یکی را انتخاب کند. حرفی که نشان می‌دهد حساسیت روی حضور او به نقطه اوج رسیده و این مربی باید شیوه فعالیت خود در فوتبال ایران را تغییر دهد.