شهاب حسینی در سال ۱۳۷۴ وقتی ۲۲ ساله بود با پریچهر قنبری از همکاران خود در تئاتر، ازدواج کرد، محمد امین، اولین فرزندشان، سال ۱۳۸۲ متولد شد. سال ۱۳۹۰ هم دومین پسرشان، امیر علی، به دنیا آمد.