روند کاهشی تراز آب دریای خزر تا پایان قرن، خشکی تالاب انزلی را سرعت خواهد بخشید و طبق نظر کارشناسان محیط زیستی تا ۳۵ سال دیگر این تالاب کاملا خشک خواهد شد. امروز شریان‌های حیاتی این تالاب ۲۰ هزار هکتاری که از زیباترین و بزرگترین زیستگاه‌های طبیعی جانوری بوده با ورود انواع فاضلاب و پساب‌های خانگی و صنعتی، گیاه مهاجم سنبل آبی و آزولا، انباشت رسوبات، عدم اجرای طرح‌های مدیریت جامع حوزه آبخیز، عدم تحویل حقابه و کاهش تراز آب دریای خزر قطع شده است. به گفته استاندار گیلان یکی از مشکلات مهم تالاب بین‌المللی انزلی ورود روزانه حدود ۳۸۰ هزار مترمکعب فاضلاب به این تالاب است، که اثرات زیست محیطی بسیاری بر پیکره تالاب انزلی وارد کرده است. تالاب زیبای انزلی با این حال هنوز یکی از مقاصد مهم گردشگری گیلان و دریای خزر است که سالانه پذیرای مسافران بسیاری از اقصی نقاط کشور است.