گروه ورزش|شهرآرانیوز، بحث حضور کریم باقری در تیم ملی مدت ها است در رسانه‌ها داغ است و حتی به دفعات از قول گل محمدی، سرمربی این تیم نقل شده که بابت حضور کریم در تیم ملی دلخور است و این موضوع را در منافات با منافع باشگاهش می‌داند. گل محمدی اما این موضوع را منکر می‌شود:««من هرگز نگفته‌ام که دستیاران‌مان را به تیم ملی نمی‌دهیم. ما همواره به تیم‌های پایه و تیم‌های ملی بزرگسال کمک کرده‌ایم و منتی از این بابت سر هیچ‌کس نداریم باعث افتخار است که هم مربی و هم بازیکنان پرسپولیس در تیم ملی حضور داشته باشند اما تعامل بین فدراسیون و باشگاه می‌تواند به هر دو طرف کمک کند. ما دنبال این تعامل هستیم. دنبال گرفتن امتیاز و گروکشی هم نیستیم. باید تعامل وجود داشته باشد تا بتوانیم به همدیگر بیشتر کمک کنیم.»